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医院设有产科、妇科、辅助生殖科、生殖遗传科、计划生育科(生育调节科)、乳腺科、新生儿科等,是全国妇产科住院医师规范化培训基地、全国助产士规范化培训基地;上海市妇产科、麻醉科、新生儿专科、临床病理科专科医师规范化培训基地;卫生部四级妇科内镜手术培训基地、卫生部准入的辅助生殖医学中心、国家卫计委准入的高通量测序pgd和nipt临床应用试点单位、国家孕产期保健和国家更年期保健两项特色专科建设单位和上海市产前诊断质控中心。医院还建有上海市胚胎源性疾病重点实验室、上海交通大学医学院出生缺陷与罕见病临床研究院,拥有两个博士学位点、四个硕士学位点,我院也是博士后培养单位,可招收基础医学、临床医学、生物学等方向博士后。